Il a été nommé à ce poste le 21 juillet 2010 pendant le conseil des ministres.

En 2003, Alain Régnier est directeur de cabinet de la secrétaire d'Etat à la lutte contre la précarité et l'exclusion, avant d’être, en 2006, sous le cabinet de Dominique de Villepin alors Premier ministre, conseiller pour la cohésion sociale, l`égalité des chances, la lutte contre l`exclusion et le logement.

Il a été nommé en 2008 au poste de délégué général pour la coordination de l'hébergement et de l'accès au logement des personnes sans abri ou mal logées. Auparavant, il était préfet délégué pour l'égalité des chances auprès du préfet de la région Rhône-Alpes depuis mars 2007.

Depuis 2008, il a été nommé successivement responsable du chantier national, du pôle de lutte contre l'habitat indigne puis du comité interministériel pour le développement de l'offre de logement avant de devenir le délégué interministériel pour l’hébergement et l’accès au logement des personnes sans-abri ou mal logées.